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如果苹果手机的短信全部消失了，可以尝试以下几种方法来恢复。
1、检查是否删除模式开启导致短信丢失：打开设置，找到信息应用，查看是否开启了“删除模式”，如果开启了，请关闭此选项，然后重新登录Apple ID账号尝试恢复短信。
2、iTunes备份恢复：如果之前有通过iTunes备份过手机数据，可以使用iTunes备份恢复功能尝试找回短信，连接手机到电脑，打开iTunes，选择从备份中恢复功能即可，但这种方法可能会覆盖当前手机的数据，建议先尝试其他方法。
3、使用iCloud备份恢复：如果使用了iCloud备份功能，可以尝试使用iCloud备份恢复数据来找回短信，连接手机到Wi-Fi网络，打开设置中的iCloud备份功能，选择立即备份，备份完成后，使用相同的方法恢复数据即可找回短信，同样地，这也可能覆盖当前手机的数据，建议在操作之前先做好数据备份。
4、使用第三方软件恢复：如果没有进行iTunes或iCloud备份，可以尝试使用第三方软件来恢复删除的短信，通过搜索并下载专业的数据恢复软件来尝试找回短信，但这种方法需要谨慎操作，避免对手机造成损害或数据泄露风险。
如果以上方法均无法找回丢失的短信，建议联系苹果官方客服寻求帮助，为了避免数据丢失的风险，建议定期备份手机数据并妥善保管Apple ID账号和密码。